Αντίθετος βρίσκει τον δήμαρχο Θεσσαλονίκης, Γιάννη Μπουτάρη η επανασύσταση του υπουργείου Μακεδονίας Θράκης. Μιλώντας στη συνεδρίαση του δημοτικού συμβουλίου ο Γ. Μπουτάρης τόνισε ότι αν το υπουργείο δεν έχει αρμοδιότητες και εξυπηρετεί το πελατειακό σύστημα, η διοίκηση του δήμου είναι αντίθετη στην επανασύσταση του.
Ο επικεφαλής της αξιωματικής αντιπολίτευσης, Κώστας Γκιουλέκας επεσάμενε ότι λόγοι εθνικού συμφέροντος υπαγόρευσαν την επαναλειτουργία.Ο επικεφαλής της παράταξης, «Ενεργοί πολίτες-Οικολογία στην πράξη», Χρήστος Μάτης σημείωσε ότι η λειτουργία του υπουργείου είναι θέμα συμβολισμού και όχι ουσίας.